Información

Subpoblaciones de diferencia genética vs tasa de movimiento


Alguien me dijo que si un genetista no encuentra una diferencia significativa entre 2 subpoblaciones que tienen superposición espacial temporal, es posible que todavía estén casi cerradas (sin conexión). ¿Es esto correcto?

¿Puedo deducir algo sobre el tipo de cambio individual entre poblaciones y la similitud / diferencia genética? Por ejemplo, se necesitaría que el 5% de los individuos cambiaran de población para mantenerlos casi genéticamente idénticos. ¿Esto difiere entre especies (digamos peces y mamíferos)?

Gracias.

ps: cualquier referencia a esto sería genial


[…] Si un genetista no encuentra diferencias significativas entre 2 subpoblaciones que tienen superposición espacial temporal

Esto no está claro. ¿Diferencia significativa entre qué? ¿Qué hipótesis estadística está probando para la cual no se encontraría una diferencia significativa (aceptada la hipótesis nula). ¿Quizás está pensando en una prueba t entre las pruebas de diferencia entre los rasgos fenotípicos promedio?

puede ser que todavía estén casi cerrados (sin conexión). ¿Es esto correcto?

¿Quiere decir que no hay flujo de genes (también conocido como no migración)?

¿Puedo deducir algo sobre el tipo de cambio individual entre poblaciones y la similitud / diferencia genética?

El "tipo de cambio individual" se denomina típicamente "migración" o "flujo de genes".

Hasta cierto punto, sí se puede. Pero la pregunta es realmente amplia y será difícil de responder en un sentido general. Solo proporcionaré una metodología muy común aquí.

Puede calcular $ F_ {ST} $, una estadística de divergencia poblacional. Un muy buen artículo que explica las matemáticas de $ F_ {ST} $ es Nei (1973). Recomiendo calcular $ F_ {ST} $ siguiendo a Weir y Cockerham (1984). Entonces, si puede asumir un modelo de isla finita (tasa de migración igual $ m $ entre dos poblaciones cualesquiera) y un tamaño de población constante y conocido $ N $, entonces

$$ F_ {St} = frac {1} {1 + 4N (m + mu) frac {d} {d-1}} $$

, donde $ d $ es el número de demes (número de islas). Esta ecuación se puede encontrar en muchos lugares. Slatkin (1995) es un muy buen artículo, pero tenga en cuenta que su solución final difiere un poco de la que presenté (por un término cuadrado) por las razones explicadas en Charlesworth (1998). Puede resolver $ m $ y reemplazar los $ F_ {ST} $ observados y $ N $. Tenga en cuenta que, dependiendo de los marcadores utilizados, $ mu $ será insignificante en comparación con $ m $.

Es posible que desee echar un vistazo a la publicación muy relacionada ¿Cómo se puede calcular el flujo de genes entre dos poblaciones?


Ver el vídeo: Los viernes de la evolución; Un diálogo sobre genética de poblaciones (Enero 2022).